Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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