Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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