Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms