Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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UBE2E3Q969T4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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UBE2E3Q969T4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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UBE2E3Q969T4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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UBE2E3Q969T4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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UBE2E3Q969T4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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UBE2E3Q969T4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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