Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD1Q8NHV4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms