Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms