Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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