Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms