Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WSCD1Q658N2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms