Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP350Q5VT06 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms