Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC27A3Q5K4L6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms