Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms