Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms