Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTLL9Q3SXZ7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.8 ms