Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms