Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RTN1Q16799 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RTN1Q16799 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RTN1Q16799 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RTN1Q16799 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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