Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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