Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED1Q15648 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED1Q15648 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED1Q15648 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED1Q15648 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED1Q15648 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED1Q15648 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED1Q15648 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms