Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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