Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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