Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RFTN1Q14699 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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