Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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