Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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