Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FHL3Q13643 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms