Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms