Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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TCIRG1Q13488 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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