Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms