Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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