Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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