Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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