Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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FOXF2Q12947 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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FOXF2Q12947 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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FOXF2Q12947 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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FOXF2Q12947 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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FOXF2Q12947 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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