Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TWF1Q12792 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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