Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms