Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms