Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG7O95352 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms