Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLGNO14967 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLGNO14967 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms