Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9YO00507 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9YO00507 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9YO00507 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9YO00507 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9YO00507 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9YO00507 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9YO00507 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USP9YO00507 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
USP9YO00507 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms