Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms