Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms