Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHANK2Q9UPX8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms