Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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