Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms