Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms