Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms