Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms