Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB11FIP5Q9BXF6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB11FIP5Q9BXF6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB11FIP5Q9BXF6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB11FIP5Q9BXF6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB11FIP5Q9BXF6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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