Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms