Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIRT1Q96EB6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms