Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RTP4Q96DX8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTP4Q96DX8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTP4Q96DX8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTP4Q96DX8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTP4Q96DX8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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