Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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